Se ubica en los Municipios de Seyé, Acanceh, Timucuy,Homún, Cuzamá, Tecoh, Tekit, Tahmek, Hoctún, Xocchel, Hocabá, Sanahcat y Huhí del estado de Yucatán, en tierras pertenecientes al régimen ejidal y terrenos particulares y con una superficie total de 2,192.08 km2 o su equivalente a 219,207.83 hectáreas.

Se encuentra entre 18 y 10 metros a nivel del mar, está representada por ecosistemas típicos de la selva seca de la península de Yucatán, donde predomina la selva baja caducifolia con suelos tipo rendzina y vegetación secundaria en la mayor parte del territorio, con precipitaciones medías que varían entre 800 a 900 mm al año. 

La población que depende de la reserva asciende a 1´350,627 habitantes, que representan el 69% de la población del estado de Yucatán, integrada por 17 municipios, donde habita el 57% de la población estatal y se aprovecha el 41% del agua de todo el estado; lo que destaca la importancia como área de recarga, transición y descarga de la zona metropolitana de Mérida, que la sitúa como el espacio geográfico de mayor presión en el uso del agua de toda la península de Yucatán. La Reserva se establece con la finalidad de garantizar que los beneficios derivados de los servicios, particularmente hidrológicos, de los ecosistemas contenidos en su territorio se distribuyan de forma equitativa para mejorar la calidad de vida y los niveles de bienestar de la población.

La reserva requiere de soluciones a su problemática hídrica, a través de acciones que contribuyan a la conservación y preservación de las aguas subterráneas para garantizar su disponibilidad en el futuro, como la restauración y conservación de los ecosistemas de selva baja y de los cenotes en las áreas de recarga para garantizar la permanencia del principal servicio ecosistémico básico que es la provisión de agua en Yucatán.